現在的毛利小五郎因為自己享有的“沉睡的小五郎”的聲譽而享譽世界，並且擁有眾多的粉絲，所以走在哪裏都有一種趾高氣昂的態度，因為他，我們現在能看到警方已經在更進一步地靠近黑衣組織的內部秘密，既然如此，為何黑衣組織幕後大boss不直接下令將毛利小五郎處理掉，讓他離開這個世界，然後直接切斷警方的線索呢？我認為有以下幾點原因可以説明：
【一】黑衣組織內部一團散沙，屬下以自己的利益為主，而毛利小五郎代表着警方，幕後大boss心有餘而力不足
黑衣組織內部人心不齊，一團散沙，各位其利
黑衣組織表面看起來實力強大，但實則他們的內部已經潰敗，內部人員人心不齊，沒有團結的力量，幾乎就是一團散沙，各自為了自己的利益而奔赴前往，但是並不是為了組織最大利益。
貝爾摩德為了自己心中的angle，沒有向組織上報柯南的真實身份，而她明知道柯南就是直擊組織心臟的那顆銀色子彈，卻依然將秘密保守到底，可見她已經為黑衣組織埋下了一顆炸彈。
另外的琴酒他現在已經被愛情衝昏了頭腦，並且沉浸在自己所幻想的愛情當中，表面看起來是在追逐灰原哀，為組織清除背叛者，但實則他並沒有傷害灰原哀，反而因為一味地去追尋小哀而耽誤了其他的事情。組織當中最有實力的兩個人已經為了自己的利益而放棄了組織交代的任務。
這樣的一個四分五裂的團隊，談何力量與成功？
毛利小五郎有後背力量，幕後大boss有心無力
現在毛利小五郎其實就是警方的代表，他跟隨警方一路去偵查案件，並且也參與了黑衣組織這宗棘手的案件，毛利小五郎現在他不僅有柯南的幫助，最主要的還有警方的後備力量，而我方人員還有FBI的人員都已經安插在了黑衣組織當中充當卧底，一方面可以收集到有利的信息，另一方面又可以裏應外合。
如果黑衣組織幕後大boss想要除掉毛利小五郎，那組織當中的卧底也一定會第一時間獲知，這樣就可以為小五郎贏取應對措施的時間。
總而言之，黑衣組織現在的力量敵不過毛利小五郎的後備力量，幕後大boss有心無力，而且他又不願意自己動手。
【二】幕後大boss之所以不露面就是為了防止警方找到，他只想悶聲發大財，不想引起引火燒身
幕後大boss不想引火燒身，小五郎一旦遇害必將引起整個國家的轟動
黑衣組織當中的幕後大boss，至今無人知道他的真實身份，只是謠傳貝爾摩德可能見過他的真面目。但是現在警方沒有直接的證據可以抓捕貝爾摩德，所以這一條線索又相當於中間截斷。通過幕後大boss不露出真容這一個行為，我們可以知道他其實為了防止被警察抓到，因為只有將自己的信息保存完好，即使最後警察將黑衣組織一起殲滅，但是也不會波及到自己。
現在雖然他們私底下在進行違法交易，甚至於會傷害到其他百姓的性命，可是總體而言他沒有去直接挑釁警方的力量。
他知道一旦開始挺挑釁警方，那勢必會引起大亂，將自己的全盤計劃打亂，他並不想引火燒身，所以沒有去指派自己的下屬完成追殺毛利小五郎的任務，畢竟現在毛利小五郎的聲譽已經響徹全國。
如果小五郎被害，必然會引起整個國家的轟動，而且也會直接引起國家的重視，到時候黑衣組織應對的就不單單是我方的警察力量，而是整個全國的人民的力量，得不償失。
幕後大boss不露出真容表示利益是他最重要的
我們通過現在黑衣組織的所作所為，包括現在他們又在研製aptx4869，這種不明藥效的藥物，可以知道他們野心勃勃，總體而言，其實他們最在意的就是利益，他們想要掠奪更多的錢財，至於名譽他們本身就是已經被打上了惡勢力這樣的一個標籤，所以難以洗白的，並且現在可以通過黑衣組織他們的肆意妄為可以判斷他們不在乎名譽，最終目的就是想要得到更大的利益，似乎利益才能給到幕後大boss足夠的安全感。
由此可以判斷他想要的就是錢財，如果他得到了錢財，他就不會再做其他無謂的鬥爭，所以現在毛利小五郎還沒有受到傷害。
【三】幕後大boss瞭解“沉睡的小五郎”內幕，小五郎不足以威脅到黑衣組織的生死存亡
黑衣組織已經摸查清楚“沉睡的小五郎”不是小五郎的真相
現在已經有一部分人知道“沉睡的小五郎”並不是小五郎叔叔真實力得來的，是背後的江户川柯南輔助力量之後得到了這樣一個響徹世界的名譽。作為一個這麼高調的人物，幾乎全世界的人都是毛利小五郎的粉絲，這樣的一個人自然會引起黑衣組織的重視，畢竟黑衣組織代表的是惡勢力，而毛利小五郎代表的是正義。
只有知己知彼才能百戰不殆，這個道理黑衣組織自然明白，他們也有自己的儲備力量，自然而然就會想要通過一些其他的途徑去獲知毛利小五郎的底細以及他的偵探實力，在這個過程當中，貝爾摩德都能夠知道柯南是工藤新一，也知道灰原哀就是曾經的宮野志保，難道一個小小的毛利小五郎就查不出來嗎？自然是可以的。
由此可以説明幕後大boss已經瞭解了內幕，知道“沉睡的小五郎”的真相，歸根到底毛利小五郎他本身是不具有這麼強的實力的，在黑衣組織眼裏的小五郎只是一個不起眼的人。
黑衣組織知道小五郎是渾水摸魚，認為其不足以威脅到組織的生死存亡
黑衣組織幕後大boss知道現在的毛利小五郎其實就是在渾水摸魚，他的偵探水平還是停留在過去，而他過去的普通偵探水平自然是威脅不到組織的生死存亡的，也根本不會根據某一條線索順藤摸瓜抓到幕後大boss，所以也是因為這一點導致幕後大boss對毛利小五郎不放在眼裏。
我們可以看到現在已經有很多黑衣組織的人來到了柯南和灰原哀的身邊，那可見他們已經知道了事實的真相，其真正的目的還是要除掉江户川柯南，也就是曾經的工藤新一，只是因為現在貝爾摩德也開始保護柯南，沒有讓琴酒得手。
那麼對於一個不能夠威脅到自己組織生死存亡的一個人，何必去為了他而浪費自己的資源呢？
結語
綜上所述，毛利小五郎的後備力量是強大的，對於黑衣組織而言他們現在內部一團散沙，每個成員都有屬於自己的利益，他們已經不把組織最大利益放在第一位置。
因為人心不齊，所以導致力量不能夠抵擋警方力量，加之黑衣組織已經瞭解到“沉睡的小五郎”的真相，所以他們知道毛利小五郎的實力不足以威脅到組織的生死存亡，也就沒有將他當作主要的攻擊對象。