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新冠肺炎疫情重創航空業，國泰航空也未能倖免。
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6月9日，國泰航空發佈公告稱，國泰董事局宣佈建議實施一項資本重組計劃，集資總額約390億港元。
資本重組建議包括:
1. 優先股及認股權證發行，即建議由國泰向Aviation 2020 Limited發行的:優先股，總認購金額為195億港元；可認購股份的認股權證，總行使價為約19.5億港元；
2. 供股，即建議按於供股記錄日期每持有十一股現有股份獲發七股供股股份的基準按 供股認購價4.68港元進行供股2,503,355,631股供股股份，集資總金額為約117億 港元；
3. 過渡貸款，即由Aviation 2020 Limited向國泰提供的已承擔過渡貸款融資，金額為 78億港元。
值得注意的是，香港特區政府參與了本次資本重組，並出資近300億港元。公告顯示，Aviation 2020 Limited是由財政司司長法團全資擁有的公司，也就是香港特區政府資產。
資本重組完成後，Aviation 2020 Limited將持有國泰航空6.08%的股份。太古、國航和卡塔爾航空等股東股份將減少。
國泰航空稱，提出資本重組建議是要應對一系列突發事件，包括爆發了已對航空業帶來重大挑戰的新型冠狀病毒全球大流行。各地政府實施的旅遊限制已導致國泰集團在出入境旅客方面客運量大幅減少，並對國泰集團未來前景和營運帶來不確定性。
新冠肺炎疫情重創航空業，國泰航空也未能倖免。今年4月，國泰港龍累計載運了13729名乘客，平均每天僅為458人，相比去年同期下降了99.6％。今年前四個月，國泰港龍載運乘客人次同比下降64.4%，運力下降49.9%, 收入乘客千米數下降59.1%。
國泰航空稱，管理團隊一直以積極靈活的態度應對目前艱難局面。集團推行了多項現金保存措施，包括將客運運力削減97%、實施高層減薪、推遲訂購新飛機，及實施員工自願性無薪假計劃等。但客運收入同比下跌超過99%， 意味着國泰自2020年2月以來每月虧損現金25至30億港元。
國泰航空顧客及商務總裁林紹波此前表示，截至今年4月，國泰港龍兩家航空公司未經審計的淨虧損為45億港元，而公司的財政前景至少在未來數月仍然非常暗淡。
國泰航空認為，本次資本重組預計可令國泰處於更為有利的位置以積極參與競爭，並在危機解決時令國泰業務重新增長。
除資本重組建議之外，國泰航空董事局擬實施新一輪高層減薪以及第二輪員工自願性無薪假計劃，並就長遠而言全面重新評估國泰集團經營模式，以滿足香港航空需要，同時保持國泰的財務狀況在穩健水平。