如上所述，秦始皇的身世之謎流傳了兩千多年，根源便在於司馬遷在《史記》中不同的記載，再加上趙姬與呂不韋之間混亂的關係，導致呂不韋是秦始皇生父之說一度甚囂塵上。不過，秦始皇應當是異人之子無疑，主要有以下幾點原因。
現代普遍認為，司馬遷為了確保史料的完整性，遂將自己認為最可信的史料，用於“本紀”和“表”的撰述，而將可信度較低的說法，則保留在了列傳之中，甚至將互相矛盾的史料並列於一處，留下讓人思考和回味的隱語。
其實仔細翻閱《史記》，便不難發現一個有趣的特點，“本紀”中的敘述大多為陳述歷史事件，重點突出對歷史事件的記載；而“列傳”之中的記載則豐富了很多，大量穿插著人物對話和事件細節描述，讀之彷彿讓人身臨其境一般。
正如秦始皇的身世，《秦始皇本紀》中只是對其身世做了陳述，而《呂不韋列傳》則較為豐富地還原了當時的場景，事實上呂不韋當時是否真的發怒，後世的司馬遷怎麼可能知道。不過，這些坊間的傳聞趣事，儘管可信度較低，但刪去又未免可惜，因而司馬遷便用隱喻和矛盾的筆法，以遺聞軼事的形式將不同來源的史料儲存了下來。
如上，“本紀”記載的可信度無疑要比“列傳”高很多，而當“本紀”和“列傳”記載出現衝突時，通常採用“本紀”的記載，而“列傳”的說法則更多為趣談。
受“宗法制”影響，古人對於血統問題極為重視，尤其是王位傳承這種大事，根本容不得半點馬虎。如果秦始皇的血統真的存在問題，哪怕是有一絲可疑之處，其即位的可能性都幾乎為零。
如果真如《史記·呂不韋列傳》所載，趙姬“至大期時，生子政”，那麼秦始皇的血統便存在著巨大疑點。“期”古音為“jī”，指一週年或指婦女足月分娩的日期。我們分別來分析：
“期”指足月分娩：如果趙姬是足月生下的嬴政，而她在嫁給異人之前已經懷孕，那麼也就是說，趙姬在嫁給異人不到十個月的情況下，便生下了秦始皇，這顯然也不符合常理，豈能不引起他人懷疑？
如上，無論這裡的“期”是什麼意思，“列傳”的記載要麼不符合生理，要麼不符合常理，都足以引起他人懷疑。
要知道，在秦始皇返回秦國之前，異人已經在秦國另行娶妻生子，如果秦始皇的身世真的存在疑點，由於事關王室血脈，他是必然不能被立為繼承人的，即使有呂不韋的幫助也不太可能。然而，事實上在漢朝之前，嬴政從出生到其被立為繼承人，再到其繼承王位位置，始終沒有人對其身世產生懷疑，甚至連一絲流言蜚語都沒有出現。
在遇到呂不韋之前，由於異人母子均不受安國君的寵愛，再加上安國君有兒子多達二十多人，異人可以說沒有絲毫繼位的可能，否則也不太會被送往趙國邯鄲作為質子。而呂不韋之所以認為異人“奇貨可居”，主要看中的就是異人的秦國宗室身份。
而呂不韋這一系列操作的關鍵，便是異人及其子孫的血統問題，而一旦嬴政的血統出現問題，即使呂不韋有翻天的本事，也根本沒有辦法將異人扶上王位。因此，對於呂不韋來說，維護秦王血統的純正和可信，乃是其最為首要的問題，他不敢有絲毫的懈怠，他豈會在這一問題上犯糊塗，恐怕避嫌還來不及。
有人或許會說，呂不韋難道不是想透過將自己的兒子扶上王位，從而實現謀國之舉嗎？個人認為不太可能。首先，與《呂不韋列傳》記載衝突，如果呂不韋真的有此野心，那麼在異人看中已經懷孕的趙姬後，呂不韋又為何要發怒呢？這豈不是正中下懷，他難道不應該欣喜若狂的將趙姬送給異人嗎？
其次，呂不韋不是傻子，就算秦始皇真的是他的兒子，他也有能力將嬴政扶上王位，他難道不想想，坐上王位的嬴政，真的會因為他的一句話，就認回他這個父親？除非嬴政想要國內大亂。而如果嬴政不認，呂不韋的這一系列操作豈不是竹籃打水一場空？
如上所述，呂不韋根本沒有動機將懷孕的趙姬獻給異人，否則一旦秦始皇的血統問題被發現，那麼不僅他的所有投資都將化為烏有，甚至連他本人和秦始皇，以及呂氏家族的性命都很難保證。事實上，呂不韋只是個尋求政治投機的商人，而不是個意圖謀朝篡位的野心家。
綜上所述，秦始皇的身世應該不存在問題，秦始皇的生父應當就是秦莊襄王異人無疑。此外，關於秦始皇的身世爭議，大多來源於漢代以後，這恐怕有著太多的政治因素在內。