繁榮昌盛、有81個氏族的九黎諸部落在蚩尤率領下西向進入華夏集團分佈地區，目標也可能是豫中，因為首當其衝的是居於豫東的炎帝，相傳他都於陳(今河南淮陽)。蚩尤率領的部落聯盟由於生產力水平較華夏集團略高一籌，武器製作精良又勇猛善戰，於是所向披靡，因而留下“銅頭鐵額”、“威震天下”的英名。炎帝部落無法抵擋、節節敗退，在蚩尤大軍的掃蕩下，居地全失，連一個角落也沒留下，本著同一聯合體應互相救助的原則，炎帝求救於黃帝，引發了涿鹿之戰。涿鹿之戰的戰場在何處，至今仍未有定論，《逸周書》所謂“中冀”，或為冀州中部，大體約在靠近今冀魯豫三省接界地帶的河北境內。
涿鹿之戰不同於阪泉之戰，它是在兩個部族集團之間進行的， 因而打得分外激烈，留下很多神話傳說，如說黃帝與蚩尤九戰九不勝，蚩尤作大霧瀰漫三天三夜，黃帝之臣風后在北斗星座的啟示下，發明了指南車，才衝出大霧。還傳說黃帝在困境中得到玄女的幫助，製作了80面夔皮鼓，夔是東海中的神獸，“狀如牛，蒼身而無角”，“入水則必風雨，其光如日月，其聲如雷”，黃帝用其皮蒙鼓，用雷獸之骨作鼓槌，“聲聞五百里，以威天下”。黃帝與蚩尤的戰爭延續了不少時日，最後的決戰進行於冀州之野，《山海經·大荒北經》記述了一個傳說，“有人衣青衣，名曰黃帝女魃。蚩尤作兵伐黃帝，黃帝乃令應龍攻之冀州之野。應龍畜水，蚩尤請風伯雨師，縱大風雨。黃帝乃下天女曰魃，雨止，遂殺蚩尤。魃不得覆上，所居不雨”。
反映戰鬥過程中，雙方先由巫師作法，希望藉助自然力征服對方，黃帝呼喚有翼的應龍畜水，以便淹沒蚩尤軍隊，蚩尤也請風伯、雨師相助，一時風雨大作，黃帝軍隊再次陷入困境，危急中，黃帝只得請下天女旱魃阻止風雨，天氣突然晴霽，蚩尤軍隊驚詫萬分，黃帝乘機指揮大軍掩殺過去，取得了最後勝利。黃帝的勝利得來不易，而勝利以後，又遇到很多新的困難，不僅旱神女魃制止了大風雨後神力大減，“不得覆上”，應龍參戰以後，也“不得覆上”，天上“無復作雨者”，使地上連續大旱數年。近代環境考古告訴我們，距今5000至4000年左右是自然環境又一次大變化時期，不斷升高的氣溫，持續不斷的冰川融化與降雨均驟然停止。距今5000年前後，從遼東半島到長江三角洲都留下海退的遺蹟，以後，距今4700年開始又發生了小的波動。涿鹿之戰中，那些被巫術呼喚來的暴風雨及其後的乾旱，正與氣候由平穩到發生波動的情況相合，可見這些神話不是全無根據的，它確實濃縮了對過去的回憶。