5月23日，民航局再發熔斷指令，對菲律賓航空公司PR314航班（馬尼拉至天津）等4個航班實施熔斷措施。
5月11日入境的菲律賓航空公司PR314航班（馬尼拉至天津）確診新冠肺炎旅客5例，自5月30日起，暫停該航班執行2班。5月11日入境的南方航空公司CZ328航班（洛杉磯至廣州）確診新冠肺炎旅客7例，自5月30日起，暫停CZ328航班（週二入境）執行2班。5月11日入境的廈門航空公司MF806航班（溫哥華至廈門）確診新冠肺炎旅客5例，自5月30日起，暫停該航班執行2班。5月13日入境的中國國際航空公司CA998航班（溫哥華至鄭州）確診新冠肺炎旅客10例，自6月13日起，繼續暫停該航班執行4班。上述熔斷的航班量不得用於其它航線。
民航局要求，菲律賓航空公司等4家航空公司要做好後續航班旅客安撫和機票退改等服務工作。