首先，需要向你糾正的是，新車上牌，只有到你戶口所在地的車輛管理所辦理上牌手續，而在汽車4S店，他們是辦理不了上戶手續的，他們只是有這個代辦業務而已，也就是說4S店辦理新車上牌，同樣也都是到車管所辦理的。
所以當我們瞭解了這個關係之後，就知道新車上牌，辦理手續其實都是一樣的，只是說直接去車管所上牌，屬於是自己個人辦理業務，而在4S店辦理，它們是也是要去車管所辦理的，屬於是幫你代辦，從中收取代辦費，這是主要的區別。
而自己去辦跟給4S店代辦，這裡面具體有哪方面不同呢？首先，就是費用的差別問題。如果是自己辦理的話，在資料齊全的情況下，比如說車輛三角牌，滅火器等工具齊全的情況下，自己花的費用主要有拓號費20元，也就是發動機號和車架號的拓印費，這個費一般是沒有發票的。還有就是車管所服務大廳裡面收取的130元上戶費，這是有正規發票的，除此之外，還有就是車牌的快遞費了，一般是郵政的，費用20元。這樣算下來，如果是自己直接去車管所辦理的話，上牌費用全部算下來也就是170元左右。
如果是讓汽車4S店辦理的話，都是要收取代辦費，費用從500～3000不等，一般的國產汽品牌收取的代辦費基本都在1000元以內，那些豪華汽車品牌基本都在1000以上，甚至幾千，如果你是辦貸款購車的話，可能還要高。但是，4S店去車管所辦理的話，所交的費用跟我們個人去辦理的費用，其實都是一樣的，可見這裡面的利潤是很高的，差別就是幾百甚至幾千的問題了。
以上說的是費用差別問題，接下來說的就是辦理上牌流程和時間的問題了。雖然自己直接去辦理的話，費用的確能省下不少的錢，但是畢竟對車主來說，上牌流程很多車主並不熟悉，甚至很多人都不知道如何辦理。這不但造成很多不必要的麻煩，也同樣會花費很多的精力和時間，自己去辦理，可能一天都辦不下來，甚至還要二天時間。而如果是讓汽車4S店代辦，快的話，可能半天時間就可以辦好了。畢竟這對汽車4S店來說，他們的業務水平更專業，對流程也更熟悉，更高效快捷，當然，收取的代辦費也比較高了。
綜上所述，買了新車，自己直接去車管所辦理上牌和直接給4S店代辦上牌的主要差別在於費用的差別和辦理流程和時間成本等方面都問題。如果你不麻煩，也想體驗一下自己買的車自己上牌的體驗，那就選擇自己直接去辦理上牌。如果你想省心省事，那就多花點費用，讓4S店全程代辦，也未嘗不可。