影響肺癌復發和預後的最主要因素是腫瘤大小和縱隔淋巴結轉移此外分期也是重要因素。據報道肺癌5年區域性複發率i期為6％10％期為25％35％a期為45％75％;遠處轉移發生率在i期約為20％而a期可能高達67％。n1和n2肺癌的5年生存率不超過35％和13％由於a期病人的生存率不同近來有報告將n2病人分成不同的亞群。在一項回顧性研究中andre等發現根據術前ct掃描臨床診斷為n2的病人5年生存率低於ct掃描陰性且組織病理學診斷為n2的病人。
縱隔淋巴結轉移數目和轉移組數是影響肺癌預後的另外兩個重要因素。因此術中清掃淋巴結和將其分組十分必要。目前關於最合適的外科手術步驟問題尚未達成共識。雖然許多研究顯示某些遺傳學標誌物與肺癌預後顯著相關但是沒有大樣本的多因素分析證明這些標誌物中的任何一個是獨立的預後指標或者對輔助治療反應具有預見價值。然而所有這些資料能夠幫助醫生決定哪些病人可能從輔助治療中獲益而且即使是能被完整切除的早期肺癌輔助治療的實施也有助於殺滅隱匿的轉移病灶並預防復發。胸腔放療在輔助治療中尚有爭議特別是對沒有縱隔淋巴結轉移的病人。由於超過70％的復發發生在胸腔外因而實行化療成為重要原因。然而化療並不被認為是標準的治療方案這是因為隨機臨床試驗所對比的術後輔助化療與單一手術的結果尚不一致。1995年的meta分析結果表明以順鉑為主的化療可能對根治切除術後的生存有影響隨後又進行了以新藥和毒性更低的藥物臨床試驗。化療加放療是近幾年進行的一種新的治療模式目的是提高區域性控制和降低遠處轉移。