明朝的皇陵并非没被盗过，像“思陵”，就是朱由检的墓，就被盗过。但总体来说，明朝的皇陵确实被盗得比较少，这有一些政治因素和自然因素在内。
清朝开始时，统治者为了彰显自己对于明朝并非侵略，而是替代接管，采取了比较强的保护措施。清朝明令保护前明皇陵，并把明朝皇族后代封邑在明皇陵附近，让他们自己看着，又重兵把守，这些政策都是为笼络汉族人心，但同时也保护了皇陵。
当然，不是说乾隆曾拆过思陵隆恩殿的金丝楠木吗？那不叫“盗”，那叫“明抢”。而且只是地面建筑，地宫部分始终都没动过。
再者，明皇陵和十三陵处于南京、北京郊区，虽说是郊区，但也并不是荒凉到数里之内都没有人烟的样子。而明皇陵修筑得也比较牢固，想盗墓，无法做到特别隐蔽，而声势一大就很容易被发现，盗墓贼由此顾忌，不敢动手。
再拿明十三陵来说，其地宫构造复杂，仅仅是找入口就比较麻烦。当初，文物部门曾想挖开朱棣的长陵的，但找不到地宫入口，只得放弃。盗墓贼想要盗墓，找入口，就得经常出动，增加了被发现的风险。
况且，相比之下，清朝陵墓的深度都只有几米，而明朝皇陵，例如十三陵，其深度超过20米，这样的盗墓难度，也使很多盗墓贼退却。军阀混战时期，盗墓的军阀们一心想要迅速得到财物，而不想再因盗墓举动增加开支，因此，也都选择盗挖比较容易探知和挖掘的陵墓。清朝皇陵都在深山之中，人烟稀少，军阀们只要对山区进行封锁，随便找一个理由，就可以神不知鬼不觉的偷偷对皇陵进行挖掘，位置偏远不易被人发现。
另外，实际上，明朝皇陵的施工时间比较长，算是比较完备的，基本上已经设想好了对付盗墓贼的各种手段。而清朝皇陵相较之下，施工比较仓促，其各代后人对于先皇的陵墓，也不如明朝皇族那么用心。不是说清朝皇陵做不到，而是他们的心思没放在这上面。
举个例子。清朝末年庚子事变，有一个叫廷雍的官员，以支持义和团嫌疑被八国联军斩首，死在保定。廷雍无头的躯干运回北京后，打造了一颗银头葬于清河镇。廷雍的墓至今没被盗，甚至无法找到。因为，据说当初建廷雍墓，深挖数十米，建好之后，又利用人工强行将河水改道，令廷雍墓深埋河底之下。祭扫时，只在保定城隍庙内祭祀。
清朝的皇陵要是都像廷雍墓一样，那就不可能被盗了。可是，旧皇帝驾崩，新皇帝登基，只顾着自己了，对于已经死去的先皇，意思意思就算了，实际上做得并不太用心，这才给后来的盗墓贼留下了可钻的空子。