1、要因地制宜
一個地區的綠肥種植方式，要依據自然條件和社會經濟條件因地制宜地確定。例如在人少地多、土壤瘠薄的地區，綠肥的種植就可以較多地佔用土地的時間和空間；而在人多地少、土壤肥沃的地區，綠肥種植就不能過多地佔用土地時間和空間；有機肥源廣、秸稈還田量多、土壤中有機質含量高、化肥用量大的地區，綠肥就可以少種甚至不種；有機肥源缺、秸稈還田量少、土壤中有機質含量低的地區，即使化肥施用量大，也要積極地擴種綠肥。
在作物生育期有餘、複種指數低的地區，綠肥可以採用糧肥複種方式；而在作物生育期很緊或複種指數較高的地區，綠肥的種植方式則以間作套種為宜。
2、要全面衡量經濟效益
對綠肥的種植方式和佈局，要全面衡量其經濟效益，不僅要看當季，更重要的是看週期。作物的上一茬與下一茬、上一年與下一年、上一個週期與下一個週期，存在着相互制約、相互聯繫的關係，人們從事農業生產，要在立足於搞好當季的前提下，儘量為下一茬、下一年、下一個週期做好準備，只有這樣才能實現持續增產。
綠肥的種植，實際上是一種農業基本建設，投資所帶來的經濟效益要大於投資的幾倍、十幾倍，甚至幾十倍，這種效益要在比較長遠的週期才能發揮的充分和明顯。
3、要肥田和養畜相結合
絕大多數的綠肥是良好的牲畜飼草，不僅有豐富的蛋白質、脂肪等營養物質，同時富含大量的多種維生素，並且通過糧肥輪作、複種、間種等途徑，可以達到週年供應青鮮飼草的作用。
綠肥被牲畜取食後，其化學潛能大約有16%～29%轉化到牲畜軀體，33%用於維持生命活動，49%～51%隨糞便排出，成為良好的肥料，綠肥的根茬仍有很強的肥田改土作用。
4、要充分利用可以利用的空間、時間和作物生物特性
栽培綠肥需要一定的土壤、時間、光照、温度等條件，而我國地少人多，綠肥與糧食作物的生產從時間和空間上產生矛盾，所以協調好這個矛盾是種植綠肥的先決條件和依據。要充分利用糧食作物生長期以外的可以利用的時間和空間，充分發揮不同綠肥、不同糧食作物的生物學特性，經濟利用温度和光照等資源，見縫插針地種植綠肥。
例如糧食作物生產過程中，可以考慮改換品種，生育期長的換成短的，株型散遮陰大的換成株型緊湊遮陰小的。在作物羣體結構佈局上，可以改窄行大株距為寬行小株距，改早播為遲播，改晚收為早收等，如果改得合理，可以做到當季不減產甚至增產，週期產量則大幅提高。