1. 題主題目是：當我們違背道德準則時為什麼會難受?這是關於個體自己進行社會決策時，當決策與自身道德標準或者社會道德標準產生衝突(conflicts)時候的情緒反應。因為個體進化過程中就會涉及遵從很多社會標準，包括道德準則。而違背這些準則，會引起大腦中衝突和厭惡相關的腦區活躍，如前部扣帶回(ACC)和腦島(insula)。
事實上很多研究表明我們的道德情緒反應是自發的，那麼就決定了“難受”是“不由自主”的 ^_^
2. 那麼，大腦是如何判斷一件事是否「違背」道德準則，進而引起情緒上的反應?
在現有的研究中，常用的一種道德評價範式是採用有意傷害和無意傷害材料讓個體進行判斷，這類研究發現了大腦的右側顳頂聯合區(RTPJ)和心理推論相關的腦默認網絡(DMN)參與了這一過程。
具體而言，首要的相關腦網絡是包括眶額在內的腹內側前額葉(vmPFC)，這就是進行道德評價的主要腦區。這也是為什麼一些研究發現前額葉受損，尤其 vmPFC 受損的個體，會有更多反社會行為。而且一項發展性的工作發現，在有意圖傷害條件下，青少年 vmPFC 的激活隨着年齡增加而增加。
其次，右側顳頂聯合區(RTPJ)，是我們推論他人心理狀態的關鍵腦區，在道德判斷時，對整個情景中不同角色個體的意圖進行判斷，需要這個腦區的參與。
另外，杏仁核，不錯就是題主很關心的情緒相關的位置，它在社會情緒加工中有很重要的作用。
目前神經科學的證據認為，vmPFC 整合了道德判斷的信息並且計劃行為，即腹內側前額葉調節我們的情緒反應。
3. 我們能否通過刺激大腦的某一區域，影響人們對道德準則的判斷?
能。也有一些研究者做了這方面的工作。
請看上文提到的三個不同腦區，右側顳頂聯合區是最方便進行刺激的。2010 年的一項工作對這一腦區進行 TMS 刺激，從而阻斷了人的心理推論，發現改變了個體的道德判斷而對有意傷害他人變得更為容忍。也就是，刺激這一腦區，人道德標準“降低”了。