刺客信条的世界观中，圣殿骑士与刺客斗争了数个世纪，而这次的故事发生在18世纪的法国巴黎。
主人公亚诺·多里安出生在贵族家庭，他的父亲是一名刺客，也正因为发现了这个身份，亚诺的母亲抛弃了他们父子俩。八岁时亚诺跟随父亲来到凡尔赛宫，这也是他人生的第一个转折点。
在等待父亲回来的这段时间亚诺耐不住寂寞，偷偷溜走跟着初次见面的艾丽斯到花园中嬉戏，但他因贪玩忘记了时间，再次返回等待父亲的地方时，眼前的一幕他怎么也不敢相信，时间也定格在了这一刻，他的父亲……被杀害了。而杀死他父亲的正是《刺客信条:叛变》的主角，谢依。
亚诺惊恐的神情甚至连眼泪都来不及流下，一旁的德拉塞尔发现了惊魂未定的亚诺，并把他收为养子，而德拉塞尔也正是艾丽斯的父亲，弗朗索瓦虽然是一名圣殿骑士，但他并未把亚诺也培养成一名圣殿骑士，而是任由其自然生长，在此期间亚诺也与艾丽斯互生情愫。
时光就这样飞逝，一转眼之间，亚诺已经20岁了，一直过着衣食无忧生活的他时不时就会给家里惹上一些麻烦，但故事的齿轮永远不会停止旋转，卡住齿轮的钉子也总会有被拔除的一天。
这一天亚诺如往常一般享受着自己公子爷的生活，德拉塞尔出门参加自己女儿的宴会，亚诺看着已经走远的马车还想着今天要不要偷偷跑去参加宴会，这个时候跑来一个气喘吁吁的男子，有一封信件要交给德拉塞尔，他接下了这个事关重大但他毫不知情的任务。
路上却好巧不巧碰上自己惹麻烦招惹上的冤家，信没有送成，不以为然的亚诺将信塞进宅邸的德拉赛尔的办公室就偷偷溜去参加宴会了，但他万万没有想到这是他人生齿轮转动的又一个转折点。
信中的内容正是有人要告知德拉赛尔今晚会有人刺杀他，而这封关键的信件却被亚诺忽视了，最终也被陷害，眼睁睁的又看着德拉赛尔，自己的养父死在自己面前。
悲痛的遭遇并没有让上天怜悯他，并且也因被诬陷的杀人罪锒铛入狱，但上天给你关上一扇门的时候，便会为你打开一扇窗户，在监狱中亚诺结识了他的导师-刺客大师比雷克，比雷克一眼就瞧出了亚诺的刺客天赋，教导并训练他，机缘巧合下二人成功越狱。
最后亚诺也步其父亲的后尘，成为了一名刺客，他的目标也非常明确，找出杀害他养父的真凶。
经过一路的顺藤摸瓜，虽然最终报了仇，但他也失去了很多，因为自己的一时冲动一意孤行去追杀幕后真凶，给刺客组织带来了威胁，在一番投票后，亚诺被逐出了刺客组织，并且也在与幕后黑手的决斗中，又亲眼看着自己的挚爱，艾丽斯战死。可以说亚诺的一生极其的悲凉，虽然身为历代主角中无论是行事作风还是身世都最为优雅的角色，但他的人生经历却与他的身世形成了巨大的反差。
从一个懵懂无知的调皮少年，再到惹是生非的坏小子，最后经历了一重又一重困境，目睹了亲人一个又一个死在自己的面前，亚诺终于成熟了，看清了，也看懂了。这时的他也不再幼稚，不再纨绔。但留给他的已经所剩无几了。
在游戏的最后，时光又是几年过去，亚诺手捧鲜花来到艾丽斯的墓前，回想起他们俩的过去，自己的过去，以及这一路上自己的成长……