在供應鏈領域的多層次物聯網生態系統中，區塊鏈可以解決許多跟蹤方面的問題，例如，區塊鏈技術有助於最大限度地減少假冒商品， 實現產品召回和食源性疾病。假冒產品是大多數行業的一大問題。僅在半導體行業，假冒產品使美國正規芯片製造商每年損失75億美元的收入。通過 使用區塊鏈技術，半導體制造商可以在芯片供應鏈的每個環節創建反腐敗反偽造的監管 鏈條。如果芯片被認為是偽造的，製造商可以通過該監管鏈追蹤並評估確認偽造發生的具體環節。相同的做法可以應用於故障芯片。
在製造商和零售商或客户簽訂合同後，發貨環節可能涉及使用當地船運代理、出關 港口、海關官員、運輸公司、境外入關口岸、海關服務、境外遞送代理，最後將貨物送 達客户。從始至終，客户確認收到貨物前的每一個環節都需要大量信息數據，進行多種數據確認，並保留向供應商付款的詳細信息。而這一過程十分適合與區塊鏈技術結合， 通過將物聯信息輸入/查詢分佈式分類帳，能夠在各個階段記錄和驗證所有文檔和事件 信息，以實現流暢、可驗證和安全的供應鏈管理。
食品行業可以參考區塊鏈來查明原產地，並跟蹤污染源商品的位置，預防健康危害 和召回。也可以提高交易對賬速度，使食品製造商和分銷商可迅速瞭解其供應鏈。如沃爾瑪通過將一包芒果追溯到其起源的農場來展現此技術能力，沃爾瑪使用區塊鏈+物聯網，此過程只需2.2秒，而使用傳統的數字和紙質方法需要將近7天。
Filament藉助區塊鏈技術優勢實現供應鏈溯源，無需記錄每一次機器間交易， 避免了高成本開銷。首席執行官AlIison Clift-Jennings稱之為設備端的脱鏈智能合約平台，通過這些合約可以脱離區塊鏈，實現驗證輸入和運行輸出。
航運業巨頭馬士基(Maersk)與IBM合作進行跨境供應鏈試驗。馬士基有新加坡的 太平洋國際航線，通過與眾多海關當局，貨主和貨運代理商合作，共同推進區塊鏈業務。 總體而言，航運公司佔全球供應鏈市場份額的20%以上，新加坡，美國，荷蘭等20個港口和碼頭運營商在全球擁有235個海運門户。平台宣佈了 一項新的定製化智能合約服 務，用於執行復雜的運輸訂單，並減少中間商。
IBM在此領域與芬蘭創業公司KouvoI aInnovation合作，為貨運集裝箱人工簽字等文書工作帶來的高昂成本提供解決方案。使船運貨物實現在各國間自動化無縫傳遞，記錄在安全加密的分類賬中。