自從西漢建國之後，“西域”就有了雛形，大致上來說包括玉門關西側、向南擴充套件到新疆等大片區域，後來“西域”的範圍不斷擴大，廣義上來說中國西部大片區域，其中西藏是西域的主體部分。
清朝建國之後疆域更進一步擴充套件，西域北起俄羅斯南至拉薩，東邊則靠近敦煌，這片區域面積遼闊卻缺少穩定，自從安史之亂之後，唐朝失去了控制權，因此在西域接連出現了眾多獨立政權，同時唐朝的沒落也標誌著中國失去了西域控制權，直到清朝建立，費勁千辛萬苦再一次將西域納入到祖國懷抱中，為何清朝會不遺餘力的收回西域呢？
這件事還要追溯到16世紀，當時蒙古地區興起了很多宗教勢力，尤其是黃教，黃教信眾為了發展勢力，開始發動對外戰爭，16世紀初期，衛拉特旗下的綽羅斯全面進攻喀爾喀，結果出師不利，大敗而歸，但是讓他們沒想到的是喀爾喀部落並不想善罷甘休，決定乘勝追擊，一路打到衛拉特的中心。
局勢瞬間翻轉，喀爾喀反過頭來將衛拉特打的血流成河，衛拉特人四處逃竄，一部分人向北逃走企圖得到俄羅斯人的庇護，另一部分人逃亡額爾齊斯流域，這場戰爭將原本的部落格局進行了大清洗，與最初的模樣大不相同，原本各自劃分的放牧區也陷入一片混亂，各個部落彼此爭鬥不止。
最後，在1628年前後，土爾扈特部落大舉遷徙，移居到伏爾加河，這次出走引發了連鎖反應，衛拉特可汗固始汗認為不應該繼續這樣沉淪下去了，召集部落中的重要人物們商議未來走勢。
當時很多人都覺得衛拉特如今的處境十分危險，夾在俄國與哈薩克中間，發展受到限制，為了尋求出路只能向其他方面發展，仔細思考下只能有一種可能，他們決定對察合臺後裔出手，將原本本族部落的放牧區域轉移過去，大力發展巴爾喀什湖區域，只有這樣衛拉特民族才能有出頭之日。
衛拉特效仿土爾扈特部開始大規模搬遷，離開了生活了很久的額爾齊斯河，集合優勢兵力向天山發動攻擊，這次衛拉特人沒有向上次那樣，沒用多長時間就取得完勝，此舉過後，衛拉特人佔領了大片區域，將當時的青海等地納入麾下，不過衛拉特人的強勢入駐引起了當地宗教勢力的注意。
領導格魯派勢力的班禪，看到衛拉特人表現出如此強悍的戰鬥力之後，他們決定與衛拉特人聯合在一起，1637年，固始汗出兵青海，不到五年的時間裡先後拿下了藏區大片地區，更是在1643年前後，出兵佔領了拉薩。
手握大片區域的固始汗在青海西藏建立和碩特政權，實行強硬統治，強迫後金向自己稱臣，不過在後金的強勢抵擋下，雙方最終達成和解。
當時滿清勢力也得到了長足發展，從關外打到內地，擊潰了明朝統治，中原地區土地肥沃，物產豐富，滿清定都北京城，對於這一切滿清十分歡喜，守住這一切果實就足以安枕無憂了，根本沒有任何對外擴張的想法，因此清朝僅僅要求喀爾喀蒙古每年向朝廷進貢。
當初固始汗率領部落遷徙之後，當地又進行了新一輪的洗牌，五世達賴賜予葛爾丹汗王稱號，準格爾汗國因此誕生，眾所周知，準格爾很不安分，成立之後沒多久就發動對外擴張，先後佔領了吐魯番等地，同年準格爾大軍越過天山山脈，直接打到阿克蘇地區。
準格爾的興起沒多久就建立起了龐大的統治領土，幾次西征是無人可擋，1686年，經過前兩次西征之後，準格爾大軍積攢了寶貴經驗，準備發動第三次襲擊，這一次準格爾打到裡海，將喀爾喀蒙古橫刀切斷，分割成兩部分，其中一部分迫於形勢，向準格爾低頭，另一部分堅決抵抗，對於這一部分人，準格爾沒有心慈手軟，發動大軍進攻，一時間屍橫遍野，大量難民湧向南方。
當年9月，喀爾喀蒙古針對這種情況展開會議，得到了俄國人的准許之後，知曉俄國人武力有多麼強大，喀爾喀蒙古決定向俄國投降，當時大部分大臣們都主張投靠俄國，但是也有一少部分貴族認為迴歸清廷統治才是正道。
雙方爭執不下，但是準格爾卻沒有給他們太多時間，即刻發動進攻，此時喀爾喀已經決定投入清廷懷抱了，並且清廷與俄國達成尼布楚條約，條約規定了俄國人不能與準格爾來往，這種局面下，清廷解決了後顧之憂，對於準格爾不再有所顧忌，雙方展開大戰。
最終葛爾丹兵敗身亡，他的骨灰也被後人交給清廷發落，至此這場大戰才算落幕，為了警示周邊少數民族勢力，清廷將葛爾丹挫骨揚灰，重刑責罰，解決了準格爾，為清廷收復西域氣功了巨大支援，幾年之後，清軍大舉進攻西藏，收復西藏。
常年戰爭讓雙方都精疲力竭，最終與準格爾達成協議，雙方劃分區域整治，1755年，準格爾內部矛盾重重，部落首領帶領眾多部族投降清朝，得到乾隆皇帝賞識，但是1757年，部落頭領阿睦爾薩納再度發動叛亂。
只不過阿睦爾薩納部下很多因為感染天花而死，這場戰爭也以清朝取勝而告終，阿睦爾薩納一路逃到哈薩克，最後也因為感染疾病而死，俄國人將其屍體送還給清廷，同樣被施以極刑，挫骨揚灰，此後準格爾一直生活在清朝控制下，最後發展成了現如今的新疆民族。
參考資料：
【《西域的歷史與文明簡析》、《清史稿·列傳一百一·策楞傳》、《清史稿·卷十二·高宗本紀三》】