西紅柿可以有多種食用方式，可以冷吃，也可以炒着吃，還可以和很多食物一起吃。
西紅柿是一種果蔬食品，酸甜，營養豐富，富含維生素C和鈣、鐵、磷等礦物質。但是，西紅柿中含有大量的膠體、水果品質、棉酚等成分，這些物質容易與胃酸反應，凝結成不溶性的塊狀物質，可能會堵塞胃的出口。增加胃內壓力，引起胃擴張，甚至產生劇烈疼痛。此外，未成熟的青番茄不宜食用。由於未成熟的西紅柿含有大量有毒的西紅柿生物鹼，人們會出現頭暈、噁心、嘔吐、流口水、疲勞等中毒症狀。西紅柿成熟成紅色後，西紅柿的含量會大大減少，甚至消失。
西紅柿不能和任何東西一起吃：
(1)番茄與甘薯親和性好。一起吃飯會導致結石、嘔吐、腹痛和腹瀉。
(2)魚+西紅柿：食物中的維生素C可以抑制銅的釋放。
(3)番茄與豬肝具有親和性。豬肝氧化西紅柿中的維生素C，使其失去原來的抗壞血酸功能。
(4)西紅柿與大閘蟹相容：一起吃飯會導致腹瀉。西紅柿和綠豆一起吃會損害你的活力。
(5)番茄+黃瓜：黃瓜含有維生素C分解酶，一起吃會破壞番茄中的維生素C。
(6)西紅柿與胡蘿蔔兼容：西紅柿中的維生素C可以通過分解胡蘿蔔中的酶來破壞。(8)西紅柿與鹹魚相容：一起吃飯很容易產生致癌物質。
(7)番茄與白酒相容：一起吃飯會感到胸悶、呼吸急促。
吃西紅柿的注意事項：不宜生吃，尤其是脾胃虛弱、感冒、月經不調的婦女不宜生吃。如果你只吃西紅柿作為水果來補充維生素C，或者在盛夏清熱，最好是生吃。不宜空腹進食，空腹時胃酸分泌量增加，因為西紅柿中含有的一些化學物質容易與胃酸結合形成不溶於水的塊狀物，經常會引起腹痛，造成胃不適和胃痛。